Le projet Grany a débuté en 1996, sous l'impulsion de Dominique Désérable. Il a pris la forme d'un sujet de projet pour les étudiants en quatrième année du département Informatique de l'INSA de Rennes. Au terme de cette première année est sortie la version 1 du logiciel, tournant sur des stations Sun et utilisant le toolkit OpenWindows de ces machines. Afin d'améliorer la vitesse de logiciel, 1997 a vu l'utilisation de la bibliothèque PVM. Cette version s'est relevée décevante et a abouti au retour à un moteur séquentiel. Cette version 3 a commencé à être developpée en septembre 1998. Elle utilise le toolkit GTK, de plus en plus commun dans le monde Unix. Cette bibliothèque et l'utilisation d'autres produits GNU pour le developpement font de Grany 3 un logiciel portable sur de nombreuses architectures.
